Integritas, objektivitas, dan kerahasiaan tidak akan berarti tanpa didukung oleh kompetensi yang memadai. PP-AIPI menegaskan bahwa kompetensi adalah prinsip etika keempat yang wajib dimiliki auditor, yang didefinisikan sebagai kemampuan dan karakteristik berupa pengetahuan, keterampilan, dan sikap perilaku yang diperlukan dalam tugas. Auditor harus menerapkan semua keahlian dan pengalamannya untuk memberikan layanan pengawasan intern yang berkualitas.
Kompetensi bukan hanya dimiliki saat pertama kali menjadi auditor, tetapi harus terus dipelihara dan ditingkatkan sejalan dengan perkembangan teknologi dan peraturan. Prinsip ini menuntut auditor untuk bersikap proaktif dalam belajar dan mengembangkan diri, baik melalui pendidikan formal, pelatihan, sertifikasi, maupun pengalaman kerja di lapangan.
Aturan perilaku terkait kompetensi mencakup empat hal. Auditor hanya boleh memberikan layanan yang dapat diselesaikan sesuai dengan pengetahuan dan keahlian yang dimiliki. Mereka wajib melakukan pengawasan sesuai Standar Audit Intern Pemerintah Indonesia. Selain itu, mereka harus bersedia mempraktikkan pengetahuannya untuk menyelesaikan tugas dan terus-menerus meningkatkan keahliannya.